1オープニング・解き放たれた伝説 (M1+M2)
2メタルの伝説 (M3)
3不気味な流星群 (M4)
4謎の隕石 (M5)
5巨大な影 (M7)
6現われた巨大怪獣 (M8)
7モスラの歌(本篇用) (M9)
8最強の敵,再来 (M10)
9謎のドーム 2 (M11)
10モスラ登場 (M12)
11ロラの異変 (M13)
12消える子供たち (M14)
13謎のドーム 3 (M15)
14キングギドラ飛行 (M16)
15モスラとの出会い (M17)
16モスラとの出会い (M18)
17キングギドラ,狂乱 (M19)
18決意~時空への旅立ち~ (M20)
19ハオラ モスラ(モル Ver.本篇用) (M21)
20最期の頼み (M22)
211億3千万年前に翔ぶ (M23)
22謎のドーム (M24)
23白亜紀バトル1(前半) (M25)
24白亜紀バトル1(後半) (M26)
25生命をかけて (M27,M27A)
26不気味な尾 (M28)
27白亜紀バトル2 (M28A)
28ハオラ モスラ(ロラ Ver.本篇用) (M29)
29モスラ絶体絶命 (M30)
30レクイエム (M30A)
31キングギドラ復活 (M31)
32悲壮な戦い (M32)
33鎧戦士,登場 (M32A)
34ラストバトル (M33)
35最後の変身 (M34)
36伝説の力 (M35+M36)
37エンディング・心は届く (M37)
38モスラの歌
39最強の敵,再来 1
40モスラの歌 (カラオケ)
41最強の敵,再来 2
42ハオラ モスラ(モル Ver.)
43ハオラ モスラ(モル Ver.)
44ハオラ モスラ(ロラ Ver.)
45ハオラ モスラ(ロラ Ver.カラオケ)
46效果音:キングギドラ(声,羽)
47效果音:キングギドラ(白亜紀型)(声)
48效果音:キングギドラ(光線)
49效果音:キングギドラ(白亜紀型)(光線)
50效果音:モスラ(声,光線a,光線b,羽光線,羽音a,羽音b)
51效果音:鎧モスラ(声,羽音)
52效果音:フェアリー(声,光線)
53效果音:ガルガル3 (声,光線)
54效果音:白亜紀の恐竜たち
55效果音:モスラの会話
56效果音:ドームの心音
57效果音:キングギドラ羽光線
58シーン71(使用曲「決意~時空への旅立ち~」)
59シーン76(使用曲「ハオラ モスラ」モル Ver.本篇用)
60シーン82(使用曲「1億3千万年前に翔ぶ」)
61シーン92(使用曲「白亜紀バトル1」前半)
62シーン102(使用曲「白亜紀バトル2」)
63シーン103(使用曲「ハオラ モスラ」ロラ Ver.本篇用)
